1) Pour votre première question, c'est au Magistère de déterminer ce qui est certainement historique dans les 1ers chapitres de la Genèse. Le même décret de la Commission biblique donne les points suivants comme historiquement certains :

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Question 3 : Est-il possible en particulier de mettre en doute le sens littéral historique lorsqu'il s'agit de faits racontés dans ces mêmes chapitres qui touchent au fondement de la religion chrétienne, comme sont, entre autres, la création de toutes choses faite par Dieu au commencement du temps ; la création particulière de l'homme ; la formation de la première femme à partir du premier homme ; l'unité du genre humain ; le bonheur originel des premiers parents dans l'état de justice d'intégrité et d'immortalité ; le commandement donné par Dieu à l'homme pour éprouver son obéissance ; la transgression du précepte divin, à l'instigation du diable sous la forme du serpent ; la déchéance des premiers parents de cet état primitif d'innocence ; ainsi que la promesse du Rédempteur à venir?
Réponse: Non.

2) Concernant votre affirmation sur l'interprétation littérale des premiers chapitres de la Genèse par les Pères de l'Eglise, on voit que vous n'avez jamais fréquenté les Pères de l'Eglise. Grégoire de Nysse ou Saint Augustin par exemple enseignent que toutes les choses ont été créées simultanément.

3) Je vous conseille de relire l'encyclique Providentissimus Deus de Léon XIII qui nous donne une règle importante d'exégèse :

Pour bien nous pénétrer de la justesse de cette règle, considérons d'abord que les écrivains sacrés, ou plus exactement " l'esprit de Dieu, qui parlait par leur bouche, n'a pas voulu enseigner aux hommes ces vérités concernant la constitution intime des objets visibles, parce qu'elles ne devaient leur servir de rien pour leur salut " (3).

3. St Augustin, Ibid. 9, 20.

Aussi ces auteurs, sans s'attacher à bien observer la nature, décrivent quelquefois les objets et en parlent, ou par une sorte de métaphore, ou comme le comportait le langage usité à cette époque, il en est encore ainsi aujourd'hui, sur beaucoup de points, dans la vie quotidienne, même parmi les hommes les plus savants. Dans le langage vulgaire, on désigne d'abord et par le mot propre les objets qui tombent sous les sens; l'écrivain sacré (et le Docteur angélique nous en avertit) s'est de même attaché aux caractères sensibles (4), c'est-à-dire à ceux que Dieu lui-même, s'adressant aux hommes, a indiqués suivant la coutume des hommes, pour être compris d'eux.

4. Summa theol. p. I, q. LXXX, a. 1, ad 3.