La logique est de dire: un poids, deux mesures, faute de quoi votre expression perd tout son sens ! S'il y a effectivement deux poids, rien n'interdit donc deux traitement différents.

Il n'y a pas toujours de logique au sens où vous l'entendez dans les expressions françaises.
La logique voudrait que l'on écrive : "Faire bonne chair" on sens où on l'entend aujourd'hui et non "faire bonne chère" tel qu'on l'écrit en bon français! et pourtant...
"faire deux poids, deux mesures" est donc une expression à prendre telle quelle.
Ainsi : « Nous avons deux poids et deux mesures : nous approuvons, pour une idée, un système, un intérêt, un homme, ce que nous blâmons pour une autre idée, un autre système, un autre intérêt, un autre homme. »
Chateaubriand - Mémoires d'outre-tombe